Muchos se sorprenden pero este no es el primer encuentro entre la pandilla de investigadores y el hombre murciélago. Ya que en 1972 unieron sus fuerzas para realizar The New Scooby Doo Movies y luego en un episodio de Batman: The Brave and the Bold. Ahora bien esta película está basada en la continuación de ese capítulo del pasado.
La película muestra a los chicos de Mystery Inc iniciando un incesante seguimiento de un caso en la Ciudad Gótica. Allí enfrentan a un gran villano enmascarado y son salvados por Batman. Hasta allí toda la película sigue el mismo patrón de las aventuras de Scooby Doo.
Sin embargo en un vuelco diferente de la trama, es Batman ahora quien necesita la ayuda de los chicos para formar un gran equipo y así solucionar de una vez por todas los misterios que envuelve a esta intrigante ciudad. Específicamente se centran en un caso que en la historia de Gótica que nunca se ha podido resolver. Una película que une de manera muy cómica y misteriosa a los héroes y villanos de siempre, junto con las alocadas escenas de la pandilla Scooby Doo.
